负压病区的送风、排风系统是按清洁区、半污染区、污染区等分区独立设置；各区城的排风机与送风机应设计联动关系，清洁区应先启动送风机，再启动排风机；半污染区、污染区应先启动排风机，再启动送风机；各区域之间的启动顺序为污染区、半污染区、清洁区。
负压病房与缓冲间、缓冲间与医护走廊宜保持不小于5Pa的负压差，当负压差低于2.5Pa时系统应报警，并启动病房门口的灯光报警器。
负压隔离病房与缓冲间、缓冲间与医护走廊宜保持不小于5～15Pa的负压差，当负压差低于5Pa时系统应报警，并启动相应区域护士站的声光报警器以及病房门口的灯光报警器。
关于±5pa静压差的补充说明：
国内洁净室的实践证明，5Pa的正压可以满足关门状态下，外部空气不能渗入室内的要求。所以此次修订一律将压差改为5Pa。正负压差都是5Pa。有人认为压差大一些可以使开门时仍保持有一定压差，实践证明，开门后多大的压差都瞬间消失。国外标准中这一数值从2.5Pa到20Pa不等。即使2.5Pa可以满足要求，但从仪器测定来看，2.5Pa不易掌控。压差不是越大越好，压差太大会加大噪声甚至产生哨音，开门费力。
负压隔离病房排风高效过滤器的安装应具备现场检漏的条件，否则，应采用经预先检漏的专用排风高效过滤装置；并且排风高效过滤器应就近安装在排风口处，应有安全的现场更换条件，宜有原位消毒的措施。
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