对于空间有限或检测项目固定的实验室，可采用三区合并法，但风险更高，需更严格的操作规范。
常见合并方式： 将 “扩增区” 和 “产物分析区” 合并。
要求： 合并后，该区域内仍需划分独立的扩增和产物分析空间，并采用严格的单向工作流程和及时的清洁消毒。
各分区关键设备与环境要求
| 分区 | 关键设备 | 环境与安全要求 |
|---|---|---|
| 试剂准备区 | 超净工作台/生物安全柜、冰箱、离心机、移液器。 | 正压，洁净环境。超净工作台用于保护试剂。 |
| 标本制备区 | Ⅱ级A2或B2型生物安全柜、核酸提取仪、离心机、冰箱、振荡器。 | 负压，BSL-2防护。 生物安全柜是保护操作人员和环境的核心设备，所有涉及样本的开盖操作必须在柜内进行。 |
| 扩增区 | 实时荧光定量PCR仪、基因扩增仪。 | 独立排风，负压。仪器应集中摆放，便于管理和通风。 |
| 产物分析区 | 电泳仪、凝胶成像系统、测序仪。 | 最大负压，独立直排。 所有操作应在抽风装置下进行。 |
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